
越來越多的證據(jù)表明,阿爾茨海默氏病(AD)是一種普遍的代謝性疾病,發(fā)病機理涉及多種生化途徑的失調(diào)。目前對AD的治療方法為抗淀粉樣β(Aβ)蛋白療法,但是該方法治愈率低。所以確定AD發(fā)病機制的新靶點對于開發(fā)有效的治療方法至關重要。
伯豪生物每月匯總單細胞文章,希望對各位老師的關注或研究有幫助!4月份單細胞測序相關文獻共收錄36篇(IF>9),我們選取其中5篇與大家分享,并在文末附表中列出文獻發(fā)表期刊、研究方向和技術平臺等信息。重要!不用再費時搜索,也不用費力下載,輕松了解單細胞文章信息,文末可領取4月單細胞文章合集!
高通量測序技術的發(fā)展為人類疾病機制研究、遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、腫瘤診斷與治療等帶來了新的應用機遇。全外顯子組測序,是利用序列捕獲技術將全基因組外顯子區(qū)域的DNA捕捉并富集后,進行高通量測序的基因組分析方法。
【“小海膽”邀您看高分文章】BD 靶向單細胞多組學在低測序深度下實現(xiàn)蛋白和低豐度轉(zhuǎn)錄組同時檢測
上一回,我們著重講述了為何要進行蛋白檢測。其中幾個關鍵參數(shù)大家一定記住了吧!比如在全基因組中,mRNA和蛋白質(zhì)表達水平之間的相關性很差,在許多研究中的解釋力(explanatory power)徘徊在40%左右。這一回,我們來講述如何進行蛋白質(zhì)檢測。
之前我們略述了代謝組學的課題設計,按照設計的思路進行實驗后,就需要進行代謝樣本的收集了。今天咱按照不同類型的樣本,給大家提供一點收集的建議。
在有限的細胞核空間中,基因組的大部分是緊密折疊的,僅留下需要轉(zhuǎn)錄的部分是開放的。打開的染色質(zhì),就允許一些調(diào)控蛋白(比如轉(zhuǎn)錄因子和輔因子)跑過來與之相結(jié)合。而染色質(zhì)的這種特性,就叫做染色質(zhì)的可及性(chromatin accessibility)。ATAC-seq是利用高通量測序檢測轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的技術。 ATAC-seq只需要很少的細胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。
DNA甲基化(DNA methylation)是目前研究得清楚、也是重要的表觀遺傳修飾形式,主要是基因組DNA上的胞嘧啶第5位碳原子和甲基間的共價結(jié)合,胞嘧啶由此被修飾為5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)。別看這只是一個小小的改變,它所起到的作用卻是巨大的!有些科學家甚至將DNA甲基化叫做“第五種堿基”!