近年來(lái)致力于研究腫瘤組學(xué)大數(shù)據(jù)信息處理的理論與方法，在組學(xué)數(shù)據(jù)低維特征學(xué)習(xí)、腫瘤細(xì)胞狀態(tài)的精準(zhǔn)識(shí)別與命運(yùn)調(diào)控等方面取得了若干成果。成果發(fā)表于 Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、Gastroenterology 等國(guó)際尖端期刊，獲得國(guó)家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年科學(xué)基金資助。

報(bào)告摘要：

"腫瘤異質(zhì)性是腫瘤診療面臨的重大挑戰(zhàn)。近年來(lái)單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)的發(fā)展使得從單細(xì)胞層面解讀腫瘤異質(zhì)性成為可能。結(jié)合國(guó)際新進(jìn)展與課題組的研究成果，以肝癌、胰腺癌、白血病等為例，探討如何在單細(xì)胞水平研究腫瘤細(xì)胞以及腫瘤微環(huán)境的異質(zhì)性、如何整合單細(xì)胞組學(xué)與傳統(tǒng)組學(xué)信息。介紹課題組新開發(fā)的腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析軟件 scCancer，助力腫瘤異質(zhì)性研究。

主要研究腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析。

報(bào)告摘要：

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的發(fā)展極大地促進(jìn)了腫瘤異質(zhì)性的研究。本次分享，將介紹古槿老師課題組新開發(fā)的腫瘤單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析軟件 scCancer。該軟件在整合了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)常規(guī)分析（如聚類、差異表達(dá)分析等）的基礎(chǔ)上，還考慮了更多腫瘤樣本的特點(diǎn)，加入了以下腫瘤相關(guān)的分析：更全面的質(zhì)控、腫瘤微環(huán)境主要細(xì)胞類型辨識(shí)、細(xì)胞惡性估計(jì)、腫瘤內(nèi)部異質(zhì)性分析、細(xì)胞交互分析、多樣本整合分析等。所有分析均以用戶友好的方式進(jìn)行執(zhí)行與展示。

遺傳學(xué)碩士，在校期間主要從事基因組學(xué)和分子遺傳學(xué)研究。參與多項(xiàng)國(guó)家“863”計(jì)劃項(xiàng)目和自然科學(xué)基金項(xiàng)目；擁有高通量行業(yè) 8 年生信分析實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)，累計(jì)協(xié)助完成 400 余例科研項(xiàng)目的設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析，培訓(xùn)學(xué)員上百。目前在上海伯豪生物技術(shù)有限公司擔(dān)任單細(xì)胞項(xiàng)目負(fù)責(zé)人，對(duì)高通量基因組學(xué)技術(shù)的應(yīng)用及數(shù)據(jù)分析，尤其是 lncRNA、circRNA 等非編碼 RNA 的研究，以及單細(xì)胞水平的測(cè)序技術(shù)有豐富的經(jīng)驗(yàn)。

報(bào)告摘要：

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