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藥物研發(fā) | 單細(xì)胞測序在藥物研發(fā)中的應(yīng)用
發(fā)布時間:2021-03-22 瀏覽次數(shù):6435
目前,單細(xì)胞測序已廣泛應(yīng)用于腫瘤異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、神經(jīng)科學(xué)、胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化等領(lǐng)域的研究。

單細(xì)胞測序是在單個細(xì)胞水平對細(xì)胞的分子信息進(jìn)行檢測。與傳統(tǒng)測序不同,我們需要先將實(shí)體組織或體液中的細(xì)胞群分離成單個細(xì)胞,再通過對 DNA  或  RNA  進(jìn)行一定倍數(shù)的擴(kuò)增使其達(dá)到現(xiàn)有測序技術(shù)的低檢測水平,用于基因組和轉(zhuǎn)錄組測序,或直接對單個細(xì)胞進(jìn)行表觀遺傳學(xué)測序,從而檢測出細(xì)胞的異質(zhì)性等關(guān)鍵信息。而傳統(tǒng)的測序則是在群體細(xì)胞水平上進(jìn)行的,終得到的測序信號值其實(shí)是多細(xì)胞的平均水平,故而丟失了異質(zhì)性的信息。2011 年,Nature Methods 將單細(xì)胞測序列為當(dāng)年度值得期待的技術(shù)之一 [1];2013 年 1 月,Science 雜志將單細(xì)胞測序列為年度值得關(guān)注的六大領(lǐng)域榜首 [2];2014 年 1 月,Nature Methods 將單細(xì)胞測序列為“Method of the Year 2013”[3]。2020 年 1   月 6 號 Nature Methods 將單細(xì)胞多組學(xué)評為了“Method of the Year 2019”[4],并在線發(fā)表 5 篇相關(guān)文章。目前,單細(xì)胞測序已廣泛應(yīng)用于腫瘤異質(zhì)性、免疫微環(huán)境、神經(jīng)科學(xué)、胚胎發(fā)育、細(xì)胞分化等領(lǐng)域的研究。

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2018 年以來,越來越多的藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)開始注意到單細(xì)胞測序技術(shù)在藥物研發(fā)上的優(yōu)勢。首先是通過分析不同病人樣本的單細(xì)胞圖譜來挖掘潛在的靶點(diǎn)(細(xì)胞、通路和分子),主要是在 RNA 和蛋白水平上篩選及驗(yàn)證細(xì)胞特異性表達(dá)的藥物靶標(biāo)。其次,探究病人組織微環(huán)境中細(xì)胞類型與分子特征的相關(guān)性,如靶標(biāo)與特定的免疫細(xì)胞或基質(zhì)細(xì)胞、信號通路、空間位置、受體配體等的相關(guān)性,從而更好地確定靶標(biāo)的作用方式及細(xì)胞 - 細(xì)胞相互作用。一旦確定了靶點(diǎn),需將候選模型與病人的單細(xì)胞表達(dá)譜進(jìn)行比較,以確定匹配的模型。并且單細(xì)胞測序還能用于進(jìn)一步探究細(xì)胞構(gòu)成及基因表達(dá)在用藥前后的變化,及治療有效 / 無效之間的差異,以評估治療過程及新藥物的有效性;此外,對不同藥物及其組合進(jìn)行單細(xì)胞測序比較,還可篩選治療組合。

單細(xì)胞測序技術(shù)以其高通量、高分辨率的特點(diǎn),使人們開始意識到它在藥物研發(fā)中的巨大潛力,包括在單細(xì)胞水平上進(jìn)行高通量地藥物靶點(diǎn)篩選、藥代動力學(xué)分析、藥效評價等,極大地縮減藥物發(fā)現(xiàn)周期、節(jié)約新藥研發(fā)成本。單細(xì)胞測序技術(shù)為新藥研發(fā)注入新的希望,有助于藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)優(yōu)化新藥研發(fā)管線。

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驅(qū)動藥物開發(fā)的單細(xì)胞測序技術(shù)

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