近年來，多組學(xué)的研究一直是各領(lǐng)域研究的熱點，所謂多組學(xué)就是針對某一疾病或某一表型，從多個分子生物學(xué)角度進行多角度的挖掘。多組學(xué)的方法給生物學(xué)的研究提供了不同維度的參考，而多組學(xué)的結(jié)合也是研究人類性狀很好的方式。

通常所說的多組學(xué)包括了基因組，蛋白質(zhì)組，轉(zhuǎn)錄組，表觀基因組，蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組，和微生物組學(xué)。各組學(xué)之間相互影響相互制約，相信各位對每組學(xué)上理解都沒有問題，甚至可能是某一組學(xué)研究的專家。但多組學(xué)研究涉及到至少兩個組學(xué)以上的研究，所以需要對多個相關(guān)組學(xué)都有足夠的認(rèn)識，并且知道應(yīng)該如何將不同組學(xué)之間進行關(guān)聯(lián)。

常見的多組學(xué)研究通常是對基因組學(xué)（DNA）、表觀基因組（DNA 修飾，如 5mC）、轉(zhuǎn)錄組（RNA）3 個層面的聯(lián)合分析，但是今天小編要給大家分享的是一個較為新穎的多組學(xué)研究方向，讓我們把目光鎖定在表觀基因組和微生物組學(xué)，以探索兩者之間的互作。又已知轉(zhuǎn)錄組 + 甲基化是經(jīng)典搭配，微生物組和代謝組也是經(jīng)典搭配。因此我們也可以通過上面 4 個組學(xué)來進行研究。下面小編會講解一些案例，這些案例會提示甲基化與微生物組之間的聯(lián)合分析存在多種聯(lián)合分析的思路。

應(yīng)用方向

正式介紹案例之前，大家肯定會問，這樣的多組學(xué)研究主要的應(yīng)有方向有哪些？這樣的多組學(xué)研究是不是只適用于腸道相關(guān)的疾病呢？答案是不一定呢，小編搜索了很多相關(guān)的文獻，發(fā)現(xiàn)在很多領(lǐng)域都有這樣的研究。常見的腸道相關(guān)疾病，比如結(jié)直腸癌、腸炎；孕婦，早產(chǎn)嬰兒；精神疾病，比如雙向情感障礙；眼部炎癥相關(guān)疾病，比如葡萄膜炎等；免疫系統(tǒng)疾病，比如系統(tǒng)性紅斑狼瘡等；復(fù)雜疾病，比如肥胖、糖尿病等，主要是與環(huán)境暴露顯著相關(guān)的一些疾病。并且這一塊的研究主要都是國外學(xué)者發(fā)表的文章，小編這里認(rèn)為我們也可以就這一領(lǐng)域進行深入探索喲。

下面小編就帶大家一起看看這幾篇案例

案例展示

三個組學(xué)的平行研究

研究思路

小結(jié)

綜上所述，本研究是將 DNA 甲基化、基因表達和微生物三種多組學(xué)方法應(yīng)用于大量純化后的原代腸上皮細胞樣本。這些發(fā)現(xiàn)清楚地證明了兒童 IBD 患者中腸上皮細胞功能的疾病亞型特異性。還強調(diào)了具體的組學(xué)特征如何指示疾病狀態(tài)和表現(xiàn)，未來具有一定臨床診斷意義。

這一篇文章能發(fā)高分，小編認(rèn)為離不開兩個點：

1. 樣本數(shù)夠多；

2. 新穎的多組學(xué)組合方式！

但介于個體的異質(zhì)性，微生物組學(xué)上的差異并沒有體現(xiàn)出來。因此本次文章還是主要對表觀基因組和轉(zhuǎn)錄組，兩個組學(xué)上的深入研究和探討。而下面介紹的兩篇文章，思路上完全不同。

基于微生物組學(xué)結(jié)果進行分組，再做 DNA 甲基化研究

研究思路

文章通過 16S 測序結(jié)果中擬桿菌門 / 厚壁菌門的比例，進行分組，然后在全血樣本和脂肪組織中進行 850K 檢測，文章首先分別描述了兩組的甲基化譜。再通過差異分析，篩選到差異基因后，做 qPCR 驗證，并做了與菌群比例間的相關(guān)性。證明了肥胖受試者中脂肪組織的 DNA 甲基化狀態(tài)與腸道菌群組成有關(guān)，并且涉及葡萄糖和能量穩(wěn)態(tài)的候選基因（例如 HDAC7 和 IGF2BP2）的表達水平可以由腸道細菌種群在表觀遺傳上調(diào)控。

總結(jié)

這里介紹的兩篇文章，影響因子不同，思路也完全不同，這兩篇研究的前提是作者假設(shè)微生物的改變是發(fā)生在上游，進而導(dǎo)致表觀基因組的變化，再導(dǎo)致相關(guān)基因的表達變化。特別是馬拉加大學(xué)的那篇，不管是收樣還是思路都比較簡單的，比較容易模仿。

鑒于篇幅有限，內(nèi)容并未全部展示，如果您對其中某一篇案例非常感謝興趣，可以聯(lián)系我們伯豪生物的在線客服索要 PPT 和文獻原文哦。

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